1.品种：世界上野生灵芝有几百种，目前我国对九十余种已经有了较明确的研究。还有一些品种有待于进一步的开发。而栽培的灵芝目前只有一种，就是赤芝又叫松杉灵芝(有柄)。
　　2.生长期：野生灵芝，除我国的无柄赤芝为一年生外，大都为子实体多年生植物，有的野生灵芝生长期长达数百年，其积累的药用价值更为显著。它神奇的药效为野生灵芝披上了一层神密的色彩。异常珍稀。而栽培灵芝生长期仅为一个月。
　　3.药效积累：野生灵芝生长期越久药效积累越强。而栽培的灵芝药效是一代不如一代，到了第四代的时候，养殖灵芝其药用价值微乎其微。
　　4.寄居物：野生灵芝大都寄居於活树干、树皮、木桩或朽木上。而栽培灵芝是在腐木上，一般以段木为主。象多年生的野生平盖灵芝，被称作树舌。就是在活树干上生长著。根本无法栽培。
　　5.繁殖：野生灵芝是担孢子有性遗传。二个雄性一个雌性结合方能再繁殖成另一个小的野生灵芝。而栽培灵芝是无性遗传。再生长方式是通过菌丝分裂来完成的。
　　6.形状：野生灵芝无柄的居多，由於品种的不同形状也不尽相同。而栽培灵芝因为品种受限，目前只一种有柄的赤芝。所以野生灵芝与栽培灵芝比较好区别。
　　7.农药残留：野生灵芝生长於大自然之中，没有农药及任何有害物质残留。而养殖灵芝一般生长於人工搭建的大棚之中，其农药残留就可想而知。
　　8.有机锗与有机硒：灵芝中最有药用价值的有机锗和有机硒在养殖灵芝中是根本不含的。每一克野生灵芝之中含有机锗高达800至2000微克，含有机硒1000至4000微克。是生长二十年的野山参含量的4至6倍。
　　9.灵芝多糖、灵芝酸、总三萜及大量的微量元素：野生灵芝中多糖及灵芝酸的含量是养殖灵芝的三到六倍。而总三萜及大量的微量元素在养殖灵芝中的含量也远不如野生灵芝。