我国认识灵芝历史悠久，内容丰富，自公元前一世纪开始至今已有数千年的历史。就《本草纲目》而言，记载了灵芝等真菌有30余种，可谓世界上有关灵芝等最早的分类。1881年芬兰植物学家卡尔斯特Karsten将菌盖表皮光亮的灵芝类归之一类，建立了灵芝属（Ganoderma）。当柯Donk等学者以孢子具有双层壁和疣刺为特征进一步肯定了本属。1948年他又依据灵芝属为基础建立了灵芝科（Ganodermataceae)，甚至有学者将此科提升为灵芝目（Ganodermales)。 
 我国最早从分类学角度研究灵芝的是贾祖璋和周宗璜教授，他们于1935年各发表灵芝属1种。1939年至1964年，邓叔群教授从事中国大型真菌的研究，在1964年撰写出版的《中国的真菌》一书中，记载了我国的灵芝属29种，其中灵芝属19种，假芝属10种。为我国灵芝的研究奠定了基础。戴芳澜教授在1987年出版的《中国真菌总汇》中，记载了中国的灵芝属26种，假芝属10种，共计36种。70年代以来赵继鼎教授进一步研究灵芝类真菌，并发表了大量新种和《中国灵芝新编》等专著。 
 目前按照现代灵芝科分类，包括了4个属。中国已知灵芝属69种。假芝属（Amauroderma）29种，鸡冠孢芝属（Haddowia）1种，网孢芝属（Humphreya）1种，共计100种。近些年有些省区也进行了考察研究，据毕志树等在《广东大型真菌志》（1994）记载有28种。袁明生和孙佩琼在《四川蕈菌》（1995）中记述了8种。许瑞祥在《灵芝概论》（1992）中报道了台湾省的灵芝8种。张树庭、卯晓岚在《香港蕈菌》（1994）中记述了20种。另外目前记载比较多的还有广西省23种，云南省33种，贵州省11种，福建省已知19种，海南是我国已知灵芝科种类最多的省，多达56种，占全国总种数的56%。据最新出版的《真菌词典》第八版记载，全世界灵芝科有100种以上，我国目前已知种数足以世界灵芝科真菌物种多样性最丰富的国家之一。